생물학 논문 해석, hierarchy의 의미가 뭔가요?

생물학 논문 해석, hierarchy의 의미가 뭔가요?

작성일 2020.01.20댓글 2건
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논문에서 피규어 해석이 안되서 질문드립니다. 
대충 저 피규어 설명을 보면,

We previously identified a stem proteomic f‐LSC profile (SPP) by two‐dimensional gel electrophoresis (2D‐IPG) including some wound healing proteins, that is profilin‐1, cofilin, vinculin and grp78, lectin‐1 and thioredoxin‐1 (txn1) (Supporting Information 2, Figure 1). To elu‐ cidate the association among the stem transcriptional triad and the stem proteomic f‐LSC profile, several gene‐silencing experiments were performed. The f‐LSCs were incubated with oct‐4, sox2 and nanog siRNA individually up to 72 hours, and finally the mRNA lev‐ els of gene coding for the SPP were evaluated (Figure 1A). Relative expression analysis revealed a significant modification in the fold change (FC) values for all stem gene markers (Supporting Information 2, Table 4). In particular, in siRNA‐transfected f‐LSCs significant re‐ duction in the mRNA levels of profilin‐1 and cofilin‐1 was detected, together with an appropriate elevation of vinculin mRNA levels, when compared to the control f‐LSCs. In detail, profilin‐1 mRNA lev‐ els were decreased up to 0.49 ± 0.09, 0.29 ± 0.07 and 0.06 ± 0.012 FC in oct4, sox2 and nanog siRNA‐transfected f‐LSCs, respectively (P < 0.001) when compared to the no‐target siRNA f‐LSCs. 
To understand if a hierarchy exists behind the regulation of the stem transcriptional triad, we observed the behaviour of all three genes after silencing each of them up to 72 hours. The efficiency for gene silencing experiments of oct4, sox2, nanog was 91.51%, 88,72% and 83.32% respectively (represented in Figure 1B,C by # sign). I
 
여기서

1. *** To understand if a hierarchy exists behind the regulation of the stem transcriptional triad,  이부분이 이해가 잘 가지 않습니다. ㅠㅠ 왜 hierarchy(계층) 이 존재하는지 알아본거죠? 혹시 A번 피규어에서 profilin-1과 confilin은 감소하고 vinculin은 증가했는데 그것과 관련이 있는것인가요? 어떻게 연관시켜서 이해해야 할지 모르겠습니다. ㅠ 저것들이 증가 감소한것과 hirearchy의 존재를 확인하는게 어떤 의미가 있는건가요? 그 맥락을 좀 설명좀 해주실 수 있을까요? 

또 

2. ***  f‐LSC profile  라는 부분에서 profile을 어떻게 해석해야 할까요? 의미를 어떻게 받아들여야 할지 알려주세요 ㅠㅠ 


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profile_image 익명 작성일 -

transcriptional triad 를 조율하는데 있어서 hierarchy 가 있는지 본다는 건데 유전자/단백질은 자주 hierarchy 를 가지고 있습니다.

실험적으로 A, B, C, D 가 모두 어떤 결과 P 를 감소함이 관찰되었다 칩시다. 그런데 그렇다고 A,B, C, D 가 다 동일 선상에서 P를 조율한단 뜻이 아니에요.

A 가 B 를 증가시키고 B 가 C 를 증가시켜 P 를 감소하는 hierarchy 구조일 수 있다는 겁니다. A는 모든걸 총괄하는 마스터 레귤레이터 같은거고 그 아래 무수한 조율 인자들 중에 B 가 있고 B는 또 여러 인자와 C를 조율하고 이 C가 P 를 조율한거죠. 꼭 이런 Hierarchy 가 있는건 아니지만 그런게 있을 수 있으니 하나씩 변화를 줘보고 남어지 인자들이 영향을 받는지 아님 P 만 바뀌는지 실험해보는겁니다.

profile 엔 다양한 의미가 있어 앞뒤 실험을 봐야 정확히 어떤걸 말하는지 알 수 있습니다

profile_image 익명 작성일 -

hierarchy 이ㅣ 단어는 원래 계급으로 번역이 되는데

생물학적인 면에서는 계층으로 번역하면 되실거 같습니다.

즉, ~~ 종류의 뒤에는 계층이 존재하는지 이해하기 위해, 이런 식으로

이해하시면 되실 것 같습니다.

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