단백질 발현에 사용되는 대장균
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단백질 발현에 사용되는 대장균
우선 단백질 발현에 사용되는 대장균 주(Strain)는 단백질 발현을 최대화하기 위해서 아래와 같은 유전자들의 돌연변이를 가지는 경우가 많습니다. 아래 유전자들의 돌연변이를 가진 균주들은 그 단백질을 아예 가지지 않거나, 그 단백질이 기능을 상실합니다.
OmpT: 세균의 외막에 존재하는 아스파르트산 단백질 분해효소(Aspartic protease)
Lon protease: 마찬가지로 단백질 분해효소
hsdSB (rB- mB-): 제한효소를 통한 DNA 절단 및 DNA 메틸화 시스템
dcm: 특정 염기서열의 시토신 메틸화
예를 들어서 BL21의 경우 Lon protease와 OmpT protease가 없기 때문에 발현시키고자 하는 단백질이 분해되는 것을 예방할 수 있습니다. BL21 이외에 BL21(DE3)라는 균주도 있는데, BL21(DE3)는 T7 RNA polymerase가 있기 때문에 T7 promoter가 붙은 유전자를 발현시킬 수 있습니다.
그 외에 균주마다 특정 유전자 및 돌연변이를 가졌으며, 어떤걸 쓸 지는 실험 목적에 따라서 달라집니다. 종류가 다양하기 때문에 제가 여기서 일일히 적는 것보다는 아래 링크를 통해 확인하시는게 더 빠를 것 같네요.
https://blog.addgene.org/plasmids-101-e-coli-strains-for-protein-expression
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