꼭!! 봐야 하는 극장판 -1~5기 극장판.
고등학생 탐정 남도일 (주인공) 이 오래된 소꿉친구 유미란 (여주인공)과 놀이공원에 놀러갔다가 수상한 남자들의 거래 현장을 목격합니다. 그러다 같은 한패인 진에게 머리통을 맞아 쓰러지고 마는네요, 그때 진이 남도일에게 독약을 먹입니다. 그 약은 aptx4869 (아포톡신 사팔육구) 라고 체내에 어떠한 성분도 검출이 되지 않는,즉 약을 먹어 독살이 아닌 의문사로 남게 되는 진이 속한 조직에서 만든 약입니다. 결국 남도일은 독약을 먹었지만 다행히도 부작용으로 어려졌을 뿐이에요. 그렇게 작아진 상태로 아가사 박사(브라운박사)네 집으로 가게 됩니다. 그곳에서 미란이를 다시 만나는데요 거기서 '코난'이라는 가명을 사용하고 아빠가 탐정사무소를 하는 미란이네 집에서 지내기로 합니다. 조직의 정보를 얻을 수도 있으니까요. 여기까지가 기본 세계관이구요. 진이 속한 조직이 검은조직인데 이 검은조직 제약부에 속한 미야노 시호 (안시호) 가 아포톡신을 만든 장본인입니다. 원래 부모님이 하던 연군데 부모님의 명석한 두뇌를 물려받아 조직에서 자라면서 하고있는 것이죠. 하여튼 미야노 시호의 부모님은 연구소 화재로 인해 사망했고, 하나뿐인 핏줄 언니만이 삶의 의미이자 목적이었어요. 하지만 언니마저 자신을 조직에서 꺼내려다 사망하자 조직에게 배신감도 들고 더 이상 연구를 허지 않겠다고 선언하며 가스실에 감금됩니다. 거기서 자신이 만든 독약을 먹고 죽으려다가 코난과 같게 부작용으로 어려져 어린이가 됩니다. 쓰레기 배출구로 나와 헤메다가 쓰러졌는데 그곳이 브라운 박사 집 근처여서 브라운 박사가 거둬줬어요. 홍장미(하이바라 아이) 라는 이름으로 살아가고 았답니다!!
