교과서와 실험에서의 transformation, transfection, transduction, infec...

교과서와 실험에서의 transformation, transfection, transduction, infec...

작성일 2014.07.14댓글 1건
    게시물 수정 , 삭제는 로그인 필요

Transformation, transfection, transduction, infection이 너무나 헷갈립니다.
물론 지식인에 이미 올라와있는 답변도 보고 블로그도 보고 구글에서도 봤어요.
교과서도 봤는데, 설명들이 다 다릅니다...
석사 이상의 전공자이시거나 실제 실험실에서 실험하시는 분께서 답변을 주셨으면 좋겠습니다.


Transformation: "pure"하거나 "naked"한 DNA gene을 박테리아에 넣는 것을 의미.
실질적인 DNA조각을 넣는 것이기 때문에 셀들 간에 실질적 접촉이 없다. 
DNA를 받아들이는 셀을 competent cell이라 부른다.

Transfection: transformation에서 정제된 바이러스 DNA를 사용하는 것을 의미. 
바이러스 파티클을 competent cell에 제공한다. 셀이 바이러스를 받아들이면 셀은 바이러스를 합성한다.
(리서처들은 동물세포에서 일어나는 transformation을 transfection이라고 부르기도 한다)

Transduction

Infection: 실험에서 셀을 바이러스와 섞은 미디어에 넣는 것?

제가 알고 있는 것은 이 정도입니다...
제가 알고 있는 것을 말씀드리니 교수님께서 아니다 라고 하시면서 이런 저런 설명을 해주셨는데
중국 교수님께서 영어로 해주셔서 하나도 못 알아들었어요.
알아 들은 것이라고는 

어떤 것은 3~5%로 확률이 아주 낮은데 어떤 것은 50%까지 된다.
어떤 것은 셀 실험을 할 때마다 over expression 이나 knock down 셀을 매번 만들어야 하는데
(한마디로 일시적임..) 어떤 것은 셀 처리를 한 다음에 얼려놓고 두고두고 쓸 수 있다.
어떤 것은 셀 셀렉트? (셀이 진짜 그 진을 가지고 있는지 확인)를 해야 한다.
어떤 바이러스는 셀 셀렉트를 하는 거고 어떤 것은 직접 셀 transfection에 사용할 수 있는 것이니
잘 알아보고 구입해야 한다.
어떤 것은 바이러스와 두개의 백터를 가진 '패키지'를 사용하는 것이다.

이 정도인데 도무지 어떤 것이 어떤 것인지 모르겠습니다..
교과서에 나오는 진짜 정의와 실험적으로 어떤 백터들이 쓰이는 건지 설명해주세요.
예를 들어.... 특정 진을 plasmid에 넣는 것 transformation이라고 하는데 이 plasmid를 대장균에
넣어서 아주 많이 클로닝 시킨다.
이 대장균을 셀의 미디어에 섞어서 plasmid가 셀 안에 들어갈 수 있게 하는 것이 transfection이다.
뭐 이런 식으로요.
감사합니다.



profile_image 익명 작성일 -

transfection - 실험실에서 실질적으로 사용되는 transfection의 뜻은 DNA(plasmid/siRNA 포함)를 liposome 등의 전달체를 이용하여 동물세포에 도입 시키는 것을 말합니다.

infection - virus particle을 만들어서 그 virus soup(particle이 포함된 media)  를 동물세포에 처리하여
gene of interest를 도입시키는 것을 말합니다. 

과거에는 tansfection 을 이용하여 유전자들을 동물세포에 도입하였으나, 그 효율성이(특히 암세포주에서) 떨어짐으로, 새롭게(오래전 기준) 사용된 것이 infection 입니다. infection은 보통 유래된 virus origin에 의해
그 역할이 달라지는데(lenti or retro), 그것 까지 알 필요는 없을 것으로 보입니다. 

보통은 일시적으로 발현시키는데 transfection 을 사용하며, viral system을 이용하는 infection의 경우
동물세포의 genome안으로 integration 되도록 만들어서 stable cell line 구축이 가능하게 됩니다. 
genome으로 integration되지 않으면, 세포의 passage(계대배양) 가 지나면 사라지게 되죠.
transfection으로도 stable cell line제작이 가능하지만 그 효율이 매우 낮습니다. 반면 infection은 ~90%
정도의 효율을 보이죠.(교수님께서 말씀하신 부분이 이부분인것 같네요)

이정도면 되지 않았나 싶네요.

교과서와 실험에서의...

... 교과서도 봤는데, 설명들이 다 다릅니다... 석사 이상의... 일어나는 transformationtransfection이라고 부르기도 한다) Transduction Infection: 실험에서 셀을...