16s rRNA 관련해서 질문이 있어 올립니다.
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최근 시퀀싱 회사에 의뢰를 부탁했습니다. 물고기 장을 이용해서 장내 미생물의 종류와 분포를 보기 위함이었습니다.
장 자체를 샘플링 했으니 샘플을 통해서 나오는 gDNA에는 물고기 장의 host cell도 있을테고 stool도 있을 것이라 생각이 됩니다.
QC결과 패턴을 알 수 없게 pass와 check, fail이 나와 여기저기서 찾아보며 stool로 했을 경우 결과 좋다는 소리를 들어서 이번에는 stool로 진행해볼 생각에 있습니다.
또한 gDNA의 농도가 최소 2ng/ul이상에서 pcr이 가능하다는 소리를 들어서 농도를 체크하려고 하고 있습니다.
1. 제가 보고자 하는 것은 16s rRNA 시퀀싱을 통해서 미생물의 종류와 분포를 확인하고자 한것인데 왜 gDNA의 농도가 필요한지?
2. 16s rRNA의 농도를 볼 수 있는 방법은 없는지
3. stool로 gDNA를 만들었다면 이 gDNA 와 16s rRNA와의 관계설명을 부탁드립니다.
이제 배우고 있는 단계여서 자세한 설명 부탁드립니다!
물고기 장을 이용해서 장내 미생물의 종류와 분포를 보기 위함이었습니다.
장 자체를 샘플링 했으니 샘플을 통해서 나오는 gDNA에는 물고기 장의 host cell도 있을테고 stool도 있을 것이라 생각이 됩니다.
QC결과 패턴을 알 수 없게 pass와 check, fail이 나와 여기저기서 찾아보며 stool로 했을 경우 결과 좋다는 소리를 들어서 이번에는 stool로 진행해볼 생각에 있습니다.
또한 gDNA의 농도가 최소 2ng/ul이상에서 pcr이 가능하다는 소리를 들어서 농도를 체크하려고 하고 있습니다.
1. 제가 보고자 하는 것은 16s rRNA 시퀀싱을 통해서 미생물의 종류와 분포를 확인하고자 한것인데 왜 gDNA의 농도가 필요한지?
2. 16s rRNA의 농도를 볼 수 있는 방법은 없는지
3. stool로 gDNA를 만들었다면 이 gDNA 와 16s rRNA와의 관계설명을 부탁드립니다.
이제 배우고 있는 단계여서 자세한 설명 부탁드립니다!
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