미토콘드리아기질
[ mitochondrial matrix , ~基質 ]
내막에 둘러싸여 사이를 메우고 있는 부분. 기질부분은 과는 외막 및 내막-크리스타막에 의해 2중으로 사이를 두고 있다. 여기에 , 지방산의 β산화계, 에 관여하는 여러 효소가 존재하고 있다. NAD나 ATP 등의 보조효소나 각종 물도 여기에 존재한다.
미토콘드리아에 고유의 유전계(DNA, rRNA, tRNA)도 이 구획에 존재한다. 기질의 여러 가지 효소의 양이나 종류는 미토콘드리아의 종류에 따라 크게 다르다. 간과 같이 화학변환기능이 중요한 생리적 의의를 갖는 것에서는 크리스타 발달은 불량하지만 기질부는 상대적으로 커다란 공을 차지하며 효소의 종류도 풍부하다.